apliquei isto pk precisei de fundir dois episodios de naruto num só.
no link de seguida eh apresentado o toturial de como fazer no windows.
http://www.animeshade.com/index.php?page=tuto-hjsplit
para fazer o mesmo no meu xubuntu, bastou abrir a consola e digitar.
cat file.mkv.001 file.mkv.002 > file.mkv Enjoy